Les spécialités de master proposées à l'UFR de chimie sont : 


Le Master de Chimie propose deux parcours : Chimie Alternative et Matériaux fonctionnels. La deuxième année de master est accessible en double cursus à des élèves ingénieurs de SIGMA Clermont et Polytech Clermont-Ferrand.
Le Master Ingéniérie de conception est proposé par l'UFR de chimie en partenariat avec l'ESEPAC
Le Master Sciences du Médicament est proposé par l'UFR de pharmacie en partenariat avec l'UFR de chimie.